Levering semi-automatisch SNP-Array platform incl reagentia tbv cytogenetica

Korte beschrijving

Dit is een Europese Openbare aanbesteding van het AMC tbv levering van een semi-automatisch SNP-array platform incl. onderhoud en reagentia tbv het laboratorium Cytogenetica, met een optie tot afname van een tweede semi-automatisch SNP-array platform incl. onderhoud voor het VUMC (gezamenlijk Amsterdam UMC). AMC (en VUMC bij lichten van de optie) wenst hiertoe gezamenlijk een koopovereenkomst te sluiten met één ondernemer voor de duur van vijf jaar.
Het AMC/VUmc zoekt semi-automatisch array platform voor de SNP-array ten behoeve van de Cytogenetische diagnostiek en researchprojecten. Het AMC/VUmc wenst een SNP-array met een hoge resolutie en een snelle doorlooptijd. De mate van automatisering is hierbij belangrijk omdat dit resulteert in een verhoogde kwaliteit door een lagere foutgevoeligheid. De SNP-array moet geschikt zijn voor zowel prenatale- en postnatale diagnostiek als tumor diagnostiek. Het array platform dient een capaciteit te hebben van 3 000-4 000 testen per jaar.

Beschrijving van de aanbesteding

Dit is een Europese Openbare aanbesteding van het AMC tbv levering van een semi-automatisch SNP-array platform inclusief onderhoud en reagentia, met een optie tot afname van een tweede semi-automatisch SNP-array platform inclusief onderhoud voor het VUMC (gezamenlijk Amsterdam UMC). De aanbesteding betreft een levering van een semi-automatisch SNP-array platform inclusief onderhoud en reagentia tbv het laboratorium Cytogenetica. AMC (en VUMC bij lichten van de optie) wenst hiertoe gezamenlijk een koopovereenkomst te sluiten met één ondernemer voor de duur van vijf jaar.
Aanleiding van de opdracht
In de huidige situatie staan op beide locaties op de afdeling Klinische Genetica één arraystraat (In AMC een array-CGH straat, in het VUMC een SNP-array straat). Met deze apparatuur worden op dit moment gezamenlijk 3 000-4 000 arrays per jaar gedaan.
De apparatuur op beide locaties is verouderd en de contracten zijn verlopen, daarom zijn het AMC en VUMC op zoek naar een nieuwe semi-geautomatiseerde oplossing.
Daar de laboratoria binnen enkele jaren gaan fuseren wordt er in eerste instantie één array platform aangeschaft met een optie voor een tweede array platform.
Het array platform dient een capaciteit te hebben van 3000-4000 testen per jaar.
Doel van de opdracht
Het AMC/VUmc zoekt een opstelling voor het vernieuwen en automatiseren van de SNP-array ten behoeve van de Cytogenetische diagnostiek en researchprojecten. Om deze groepen goed te kunnen bedienen wil het AMC/VUmc een SNP-array draaien met een hoge resolutie en met een snelle doorlooptijd. De mate van automatisering is hierbij belangrijk omdat dit resulteert in een verhoogde kwaliteit door een lagere foutgevoeligheid.
De SNP-array moet geschikt zijn voor zowel prenatale- en postnatale diagnostiek als tumor diagnostiek. Het voornemen is om het beoogde systeem voor vijf jaar in gebruik te nemen.
Beschrijving van de Optie tbv VUMC: Indien nodig (en de optie wordt gelicht) wordt een tweede systeem aangeschaft welke op locatie VUMC geplaatst zal worden.Hierbij zal de benodigde reagentia niet verdubbelen daar de aantallen monsterstroom gelijk blijven, maar verdeeld worden over de twee platformen.
Opdrachtgevers van de Cytogenetica van de Klinische Genetica:
De afdeling klinische genetica is het vakgebied dat zich bezig houdt met onderzoek naar en advies over erfelijke ziekten en aangeboren aandoeningen. De Cytogenetica van de Klinische Genetica (KG) biedt een aantal diensten aan binnen het AMC/VUmc, waaronder array analyses. Circa 25 % van de arrays wordt gedaan voor prenatale diagnostiek (dit betreffen spoed aanvragen), 50 % voor postnatale diagnostiek en 20 % voor tumordiagnostiek, 5 % geschied in opdracht van research projecten binnen het AMC/VUmc. Het diagnostisch genetisch onderzoek is te onderscheiden in cytogenetische en DNA-diagnostiek, zowel tijdens de zwangerschap (prenataal), als daarna (postnataal). Daarnaast is er een tumorcytogenetisch laboratorium. Het overgrote deel van de monsters ten behoeve van de diagnostiek is voornamelijk afkomstig van klinische genetische centra in Nederland, een deel is afkomstig van Nederlandse ziekenhuizen en een klein deel van aanvragers in het buitenland.