Marktconsultatie Massaspectrometer

Stichting Katholieke Universiteit, m.i.h.b. UMC St Radboud en Radboud Universiteit

De Stichting Katholieke Universiteit bestaat uit het UMC St Radboud en de Radboud Universiteit.
Het UMC St Radboud is een centrum voor patiëntenzorg (zowel basiszorg als topreferentie- en topklinische zorg), onderwijs en wetenschappelijk onderzoek. Kennis verbindt onderzoek, onderwijs en patiëntenzorg en vormt het hart van de organisatie. Integratie van de drie kerntaken is een voorwaarde om te kunnen excelleren.
Het UMC St Radboud wil in elk van de kerntaken tot de beste academische ziekenhuizen van Nederland behoren om voldoende middelen, talenten en partners te kunnen binden. Het UMC St Radboud orienteert zich op de aanschaf van een QTOF Massaspectrometer met bijbehorende software ten behoeve van data management, data processing en data analyse. Productgroep Inkoop streeft ernaar om in contact te komen met marktpartijen welke in staat zijn om apparatuur te leveren die minimaal voldoet aan onderstaande kernspecificaties en de daarmee inzetbaar is voor de volgende toepassingen:
1.Kwantitatieve labelvrije proteoom profilering
2.Analyse en karakterisatie van intacte eiwitten Ad 1.
QTOF Massaspectrometer (hierna: MS) instrumentatie kernspecificaties:
Voor deze toepassing is de combinatie van een minimaal dynamisch bereik van 104, een minimale accquisitiesnelheid van 20 Hz, en een massanauwkeurigheid van het MS instrument van <1 ppm vereist voor het genereren van data met de noodzakelijke kwaliteit voor het type studies van het Radboud Proteomics Cente. Middels NanoLC/UPLC worden samples online gescheiden. Aanwezigheid van een nanospray ionisatiesource module bij het MS instrument is vereist om deze koppeling te kunnen maken.
Software kernspecificaties:
Voor deze toepassing is het noodzakelijk om dataprocessing tools ter beschikking te hebben die geautomatiseerd toepasbaar zijn op grote datasets (>100 metingen) voor MS en MS/MS. De software moet voor data analyse onder meer de volgende modules bevatten:
— accurate kwantitatie voor labelvrije studies alsook labeling studies,
— Combinatie van data van verschillende instrumenten en meerdere analyses,
— Ondersteuning voor verschillende fragmentatietypes (CID, ECD, ETD, IRMPD).
De software moet een totaaloplossing bieden voor alle stappen in grootschalige kwantitatieve eiwitprofiling studies door middel van bottom-up proteomics en moet in staat zijn om top-down kwantitatieve en kwalitatieve analyses uit te voeren.
Ad 2.
QTOF MS instrumentatie kernspecificaties:
Voor deze toepassing is de combinatie van een resolutie van minimaal 60 000, een massabereik van minimaal 50-20 000 m/z en de aanwezigheid van een module voor ETD fragmentatie een vereiste.
Software kernspecificaties:
Voor deze toepassing moet de software beschikken over een accuraat deconvolutie algoritme en in staat zijn tot geautomatiseerde database searching voor eiwitten via koppeling met een search engine. Vervolg procedure. Marktpartijen die in staat zijn om een product te leveren dat minimaal voldoet aan bovenstaand beschreven doeleinden én kernspeficiaties, worden gevraagd om contact op te nemen met UMC St Radboud, productgroep Inkoop. Als uiterste reactiedatum geldt 15.6.2012. UMC St Radboud Productgroep Inkoop Dhr. W. Bouman T.

De termijn voor de ontvangst van de offertes was 2012-06-15. De aanbesteding werd gepubliceerd op 2012-05-31.

• • Stichting Katholieke Universiteit, m.i.h.b. UMC St Radboud en Radboud Universiteit

• • Spectrometers › Massaspectrometers

• • Gelderland › Arnhem/Nijmegen